Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smok3bC0HKC9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smok3bC0HKC9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smok3bC0HKC9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smok3bC0HKC9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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