Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cttnbp2B9EJA2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms