Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms