Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Phf11bB4XVQ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Phf11bB4XVQ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Phf11bB4XVQ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Phf11bB4XVQ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Phf11bB4XVQ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Phf11bB4XVQ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf11bB4XVQ1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Phf11bB4XVQ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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