Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf11cB4XVP9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms