Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms