Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rd3lB2RV38 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rd3lB2RV38 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms