Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apba1B2RUJ5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms