Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrn3B2RS91 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrn3B2RS91 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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