Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf518bB2RRE4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms