Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H60cB1B213 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H60cB1B213 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H60cB1B213 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H60cB1B213 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H60cB1B213 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms