Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp40B1B1D3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms