Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930402K13RikB1AW18 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930402K13RikB1AW18 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms