Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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