Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttll11A4Q9F4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms