Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm6880A3KG45 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6880A3KG45 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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