Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CatsperbA2RTF1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatsperbA2RTF1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms