Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf39A2RT81 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf39A2RT81 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms