Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trgv2A2J008 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trgv2A2J008 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms