Protein–RNA interactions for Protein: A2AWL9

Rhox2c, Reproductive homeobox 2C, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2cA2AWL9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhox2cA2AWL9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms