Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lcn6A2AJB9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lcn6A2AJB9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lcn6A2AJB9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lcn6A2AJB9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn6A2AJB9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn6A2AJB9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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