Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prdm12A2AJ77 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prdm12A2AJ77 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms