Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Frmpd4A2AFR3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms