Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc39aA2ACP1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms