Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbbp8nlA2ABX0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms