Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtprfA2A8L5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtprfA2A8L5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PtprfA2A8L5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtprfA2A8L5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PtprfA2A8L5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PtprfA2A8L5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtprfA2A8L5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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