Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hivep3A2A884 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms