Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.05■□□□□ 0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms