Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0U1RNP2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms