Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms