Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trbv31A0A075B5J5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms