Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DDX54Q8TDD1 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms