Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRAM1Q15629 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRAM1Q15629 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRAM1Q15629 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.5 ms