Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CUL1Q13616 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.6 ms