Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SKP2Q13309 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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SKP2Q13309 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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SKP2Q13309 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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SKP2Q13309 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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SKP2Q13309 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SKP2Q13309 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
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