Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHRNEQ04844 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms