Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CLDN4O14493 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.9 ms