Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
J3KRW8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
J3KRW8 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
J3KRW8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
J3KRW8 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
J3KRW8 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
J3KRW8 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
J3KRW8 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
J3KRW8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
J3KRW8 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
J3KRW8 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
J3KRW8 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
J3KRW8 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
J3KRW8 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
J3KRW8 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
J3KRW8 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
J3KRW8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195 ms