Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GIPC3Q8TF64 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GIPC3Q8TF64 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GIPC3Q8TF64 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
GIPC3Q8TF64 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GIPC3Q8TF64 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GIPC3Q8TF64 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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