Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HIF1AQ16665 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HIF1AQ16665 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HIF1AQ16665 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HIF1AQ16665 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
HIF1AQ16665 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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