Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNAPC1Q16533 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNAPC1Q16533 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNAPC1Q16533 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms