Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SSX1Q16384 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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