Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMAD1Q15797 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMAD1Q15797 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMAD1Q15797 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMAD1Q15797 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMAD1Q15797 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SMAD1Q15797 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SMAD1Q15797 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SMAD1Q15797 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMAD1Q15797 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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