Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC3Q15034 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC3Q15034 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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