Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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GPNMBQ14956 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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GPNMBQ14956 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GPNMBQ14956 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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GPNMBQ14956 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPNMBQ14956 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPNMBQ14956 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPNMBQ14956 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPNMBQ14956 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPNMBQ14956 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPNMBQ14956 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GPNMBQ14956 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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