Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQLEQ14534 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQLEQ14534 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SQLEQ14534 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQLEQ14534 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQLEQ14534 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQLEQ14534 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQLEQ14534 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms