Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CCINQ13939 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCINQ13939 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CCINQ13939 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCINQ13939 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCINQ13939 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CCINQ13939 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCINQ13939 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCINQ13939 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CCINQ13939 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CCINQ13939 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CCINQ13939 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CCINQ13939 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCINQ13939 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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