Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
APOFQ13790 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
APOFQ13790 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
APOFQ13790 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
APOFQ13790 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms