Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MSLNQ13421 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MSLNQ13421 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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