Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXD10P28358 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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